À présent, Akin Abayomi travaille à l'Institut nigérian de recherche médicale à Lagos, au Nigeria. Auparavant, il était pathologiste en chef et chef de la division d'hématologie de la Faculté des sciences médicales de l'Université de Stellenbosch au Cape Town, en Afrique du Sud. Il est spécialiste en médecine interne, hématologie, santé environnementale et biobanque. Il a étudié au Royal Medical College of St Bartholomew's Hospital de l'Université de Londres avec des bourses du Royal College of Medicine and Pathology au Royaume-Uni et du Colleges of Medicine d’Afrique du Sud. Il a travaillé dans plusieurs pays à travers le monde en médecine interne, hématologie et biosécurité.

Le professeur Abayomi est président du comité d'accès aux données et aux spécimens biologiques du Consortium H3Africa, chercheur principal du Global Emerging Pathogens Consortium, qui a été créé au comble du foyer Ebola en Afrique de l'ouest pour répondre aux problèmes de biosécurité de l'Afrique. Akin est membre du comité sur la gouvernance des données de l'Académie africaine des sciences (AAS). Il est également le consultant principal pour les projets de sauvetage Ebola Biobank, Biosecurity et Biodata en Sierra Leone et à Lagos au Nigeria. De plus, il est consultant pour le projet de biosécurité de Lagos et le cadre de biosécurité et de biobanques de l'Organisation ouest africaine de la santé pour les pays membres de la CEDEAO.